MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 400

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	GAT	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019790	ACC	2	6	87	92	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019790	AGC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019790	TTC	2	6	285	290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019790	TGC	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019790	CAG	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019790	GCG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019790	ACCC	2	8	990	997	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_019790	ACTC	2	8	1024	1031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019790	GTGCG	2	10	1086	1095	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019790	TGCC	2	8	1118	1125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019790	CGG	2	6	1168	1173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019790	CTC	2	6	1209	1214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_019790	ATGA	2	8	2890	2897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019790	GTT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019790	GAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019790	AC	3	6	3127	3132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019790	AGTG	2	8	3150	3157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019790	GCA	2	6	3164	3169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019790	AGG	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019790	GCG	2	6	4528	4533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019790	GCC	2	6	4538	4543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_019790	GC	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019790	CAG	2	6	4764	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019790	GGC	2	6	4784	4789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019790	GCGG	2	8	4806	4813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019790	CAT	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019790	CGG	2	6	4987	4992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019790	T	7	7	5002	5008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019790	CAG	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019790	GCG	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019790	ATC	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019790	CCA	2	6	5194	5199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019790	GTC	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019790	AGG	2	6	6373	6378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019790	TTC	2	6	13969	13974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019790	CA	3	6	13990	13995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019790	TGGG	2	8	13996	14003	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019790	CGGG	2	8	14071	14078	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019790	TCG	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019790	GGA	2	6	14130	14135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019790	TGC	2	6	14218	14223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019790	CAG	3	9	14452	14460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019790	CTC	2	6	14526	14531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019790	CG	3	6	14625	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019790	ACGC	2	8	14651	14658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019790	GC	3	6	14694	14699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019790	GAC	2	6	14701	14706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019790	TTCCT	2	10	14723	14732	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019790	CAT	2	6	14752	14757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019790	GAT	2	6	14804	14809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019790	TCC	2	6	17447	17452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_019790	CAGG	2	8	17606	17613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019790	CTG	3	9	18745	18753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019790	TTC	2	6	18850	18855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019790	CTG	2	6	18935	18940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019790	TGA	2	6	19009	19014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019790	CCAA	2	8	19767	19774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019790	AGG	2	6	19832	19837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019790	TCC	2	6	19843	19848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019790	TGG	2	6	19875	19880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019790	TTG	2	6	19925	19930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019790	CCTG	2	8	19962	19969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019790	TGG	2	6	19983	19988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019790	CGG	2	6	20009	20014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019790	GCA	2	6	20016	20021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019790	CACC	2	8	20055	20062	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_019790	CTT	2	6	20065	20070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019790	CAC	2	6	20119	20124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019790	CAG	2	6	20251	20256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019790	TGC	2	6	20345	20350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019790	ACC	2	6	20457	20462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019790	AAG	2	6	20487	20492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019790	CG	3	6	20511	20516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019790	ATC	2	6	20532	20537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019790	GCG	2	6	20540	20545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019790	GGT	2	6	20558	20563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019790	GCCGAG	2	12	20610	20621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019790	ACGGC	2	10	20668	20677	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_019790	CAG	2	6	20752	20757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019790	AAT	2	6	20785	20790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019790	CTGCC	2	10	20797	20806	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_019790	TGA	2	6	20879	20884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019790	CAG	2	6	20904	20909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019790	CAC	2	6	20922	20927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019790	AGC	2	6	20963	20968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019790	GGC	2	6	21051	21056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019790	GA	3	6	21064	21069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019790	ACGC	2	8	21070	21077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019790	CA	3	6	21115	21120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019790	GAG	2	6	21141	21146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019790	GTG	2	6	21188	21193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019790	GCC	2	6	21209	21214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019790	AGC	2	6	21262	21267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019790	CAG	2	6	21327	21332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019790	GCT	2	6	21350	21355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019790	CTT	2	6	21362	21367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019790	CCA	2	6	21400	21405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019790	GTT	2	6	21530	21535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019790	TAT	2	6	21665	21670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019790	GCC	2	6	23270	23275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019790	TGC	2	6	23287	23292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019790	GCC	2	6	23300	23305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019790	AAG	2	6	23410	23415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019790	ACG	2	6	23420	23425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019790	GGC	2	6	23454	23459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019790	TGA	2	6	23517	23522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019790	CAC	2	6	23536	23541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019790	CGG	2	6	23577	23582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019790	ACC	2	6	23664	23669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019790	GCA	2	6	23697	23702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019790	CG	3	6	23727	23732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019790	AC	3	6	23754	23759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019790	CGC	2	6	23762	23767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019790	CTC	2	6	23801	23806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019790	TCA	2	6	23821	23826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019790	CGC	2	6	23856	23861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019790	CTCGG	2	10	23903	23912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_019790	TCC	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_019790	CTG	2	6	24230	24235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019790	ACG	2	6	24273	24278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019790	GCA	2	6	24295	24300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019790	TGC	2	6	24309	24314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019790	GT	3	6	24331	24336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019790	GGGC	2	8	24368	24375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019790	TGC	2	6	24406	24411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019790	GCC	2	6	24419	24424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019790	CAG	2	6	24437	24442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019790	ACC	2	6	24466	24471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019790	GCA	2	6	24530	24535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019790	CGA	2	6	24563	24568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019790	GAT	2	6	24618	24623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019790	GCCGTT	2	12	24628	24639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019790	CAC	2	6	24657	24662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019790	GAGC	2	8	24704	24711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019790	ACC	2	6	24717	24722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019790	CGC	2	6	24748	24753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_019790	CGC	2	6	24859	24864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019790	CCCAG	2	10	24891	24900	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_019790	CAG	2	6	25080	25085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019790	GGC	2	6	25256	25261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019790	TCG	2	6	25965	25970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019790	CT	3	6	25981	25986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019790	TGA	2	6	26079	26084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019790	CGA	2	6	26210	26215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019790	GGC	2	6	26220	26225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019790	TGA	2	6	26263	26268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019790	GAA	2	6	27550	27555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019790	CCA	2	6	27582	27587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_019790	GCGG	2	8	27616	27623	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_019790	CAT	2	6	28739	28744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019790	ACTT	2	8	28749	28756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019790	AG	3	6	29669	29674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019790	CG	3	6	29751	29756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_019790	GCC	2	6	29793	29798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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157	NC_019790	AACC	2	8	29889	29896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_019790	TC	3	6	29954	29959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_019790	GCA	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_019790	GCC	2	6	33933	33938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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180	NC_019790	CTG	2	6	39271	39276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_019790	GCC	2	6	39288	39293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_019790	CTG	2	6	40546	40551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_019790	GCG	2	6	53117	53122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_019790	GCAC	2	8	55121	55128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
287	NC_019790	GCGG	2	8	55330	55337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
288	NC_019790	GCT	2	6	55358	55363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_019790	CG	3	6	55391	55396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_019790	TGC	2	6	55437	55442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_019790	GCA	2	6	55462	55467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_019790	CCTG	2	8	55475	55482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
293	NC_019790	ACC	2	6	55604	55609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_019790	C	6	6	55629	55634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
295	NC_019790	CTC	2	6	55667	55672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
296	NC_019790	C	6	6	55689	55694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
297	NC_019790	GGC	2	6	55720	55725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_019790	AC	3	6	55732	55737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
299	NC_019790	AT	3	6	55797	55802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_019790	GCCT	2	8	57828	57835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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306	NC_019790	CTC	2	6	61847	61852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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311	NC_019790	GAC	2	6	62844	62849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_019790	CGG	2	6	63404	63409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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324	NC_019790	GCT	2	6	63488	63493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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328	NC_019790	TGA	2	6	63618	63623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_019790	GCT	2	6	63880	63885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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400	NC_019790	GAG	2	6	74296	74301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.